Wrth ddefnyddio peptidau, rydym yn aml yn dod ar draws dangosyddion purdeb peptid a chynnwys peptid. Efallai y bydd llawer o bobl yn meddwl tybed pam mai eu purdeb peptid yw 95% ond dim ond 80% yw'r cynnwys peptid. Mae hyn oherwydd bod y rhain yn ddau gysyniad hollol wahanol.
Purdeb Peptid: Mae purdeb peptid yn cyfeirio at swm y peptid targed a ganfyddir yn 214 nm (214 nm yw tonfedd amsugno'r gadwyn peptid) gan ddefnyddio dadansoddiad HPLC.
Cynnwys Peptid: Mae hyn yn cyfeirio at ganran y peptidau mewn perthynas â sylweddau nad ydynt yn peptid mewn sampl.
Mae purdeb peptid yn cyfeirio at gynnwys y peptid targed a ganfuwyd gan HPLC yn 214 nm (214 nm yw tonfedd amsugno'r gadwyn peptid). Heblaw am y peptid targed, gall HPLC ganfod amhureddau gan gynnwys: dilyniannau wedi'u dileu (dilyniannau targed ar goll un neu fwy o weddillion asid amino), dilyniannau cwtogi (dilyniannau a gynhyrchir yn ystod amddiffyniad), a dilyniannau heb eu hamddiffyn yn llwyr (gan arwain at y broses synthesis neu'r broses holltiad terfynol). Fodd bynnag, ni all HPLC ganfod dŵr a halwynau gweddilliol fel trifluoroacetate (TFA) ac asetad. Yn ystod synthesis peptid, mae'r dilyniant peptid yn cael ei hollti o'r resin gan ddefnyddio TFA, a chynhyrchir ychydig bach o TFA hefyd yn ystod puro. Felly, gall terfynfa amino rhad ac am ddim a chadwyni ochr eraill y peptid, fel Arg, Lys, a His, gynhyrchu symiau bach o amhureddau TFA. Mater arall yw lleithder. Mae peptidau fel arfer yn cael eu dadhydradu gan ddefnyddio lyoffileiddiad, ond er hynny, bydd dŵr yn bodoli i raddau amrywiol yn dibynnu ar y gallu rhwymo cofalent. Felly, mae peptidau a gyflenwir fel arfer yn cynnwys halwynau TFA a symiau hybrin o ddŵr, na ellir eu canfod gan HPLC, gan arwain at wahaniaethau mewn cynnwys peptid a phurdeb.
